C#，生信软件实践（04）——DNA数据库EMBL格式文件的解释器之完整源代码

下面是一个C#编写的DNA数据库EMBL格式文件解释器的完整源代码示例，其中包含了详细的代码注释。

csharp
using System;
using System.Collections.Generic;
using System.IO;

namespace EMBLFileInterpreter
{
    class Program
    {
        static void Main(string[] args)
        {
            // 读取EMBL格式文件
            string filePath = example.embl;
            List<string> lines = File.ReadAllLines(filePath);

            // 解析EMBL格式文件
            EMBLFile emblFile = ParseEMBLFile(lines);

            // 输出解析结果
            Console.WriteLine(ID:  + emblFile.ID);
            Console.WriteLine(AC:  + emblFile.AC);
            Console.WriteLine(DE:  + emblFile.DE);
            Console.WriteLine(SQ:  + emblFile.SQ);
            Console.WriteLine(Features:);
            foreach (var feature in emblFile.Features)
            {
                Console.WriteLine(   + feature.Key + :  + feature.Value);
            }
        }

        static EMBLFile ParseEMBLFile(List<string> lines)
        {
            EMBLFile emblFile = new EMBLFile();

            foreach (var line in lines)
            {
                if (line.StartsWith(ID))
                {
                    emblFile.ID = line.Substring(2).Trim();
                }
                else if (line.StartsWith(AC))
                {
                    emblFile.AC = line.Substring(2).Trim();
                }
                else if (line.StartsWith(DE))
                {
                    emblFile.DE = line.Substring(2).Trim();
                }
                else if (line.StartsWith(SQ))
                {
                    emblFile.SQ = line.Substring(2).Trim();
                }
                else if (line.StartsWith(FT))
                {
                    string[] parts = line.Substring(2).Trim().Split(new char[] { ' ' } StringSplitOptions.RemoveEmptyEntries);
                    string key = parts[0];
                    string value = parts[1];
                    emblFile.Features.Add(key value);
                }
            }

            return emblFile;
        }
    }

    class EMBLFile
    {
        public string ID { get; set; }
        public string AC { get; set; }
        public string DE { get; set; }
        public string SQ { get; set; }
        public Dictionary<string string> Features { get; set; }

        public EMBLFile()
        {
            Features = new Dictionary<string string>();
        }
    }
}

在上面的代码中，我们首先定义了一个`EMBLFile`类，用于存储解析后的EMBL文件的各个字段。`EMBLFile`类包含了`ID`、`AC`、`DE`、`SQ`和`Features`等属性。

然后，在`ParseEMBLFile`方法中，我们遍历EMBL文件的每一行，根据行的开头关键字来解析相应的字段。例如，以ID开头的行表示ID字段，以AC开头的行表示AC字段，以DE开头的行表示DE字段，以SQ开头的行表示SQ字段，以FT开头的行表示Features字段。我们使用`Substring`方法和`Trim`方法来提取字段的值，并将其存储到`EMBLFile`对象的相应属性中。

最后，在`Main`方法中，我们读取EMBL格式文件的内容，并调用`ParseEMBLFile`方法解析文件。然后，我们输出解析结果，包括ID、AC、DE、SQ和Features字段的值。

请注意，上面的代码示例仅为演示目的，实际应用中可能需要根据具体的EMBL文件格式进行适当的修改和扩展。